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口腔拭子通常是一种微创手术。它通常不被认为是痛苦的，也没有副作用。棉签通常在口腔内部摩擦几秒钟。这可能包括脸颊内侧、舌下或喉咙后部等区域。取回样本后，有时让口腔拭子干燥几秒钟。然后将其放入无菌容器中，例如保护性塑料套管或管子。保护棉签有助于避免样品污染。出于几个原因，可能会使用口腔拭子。例如，可以收集脸颊上的上皮细胞进行DNA测试。这通常用于确定孩子的亲生父母，这通常称为亲子鉴定。它还可用于将嫌疑人与包含DNA证据的犯罪现场联系起来。口腔拭子也可用于诊断某些疾病。例如，可以从喉咙采集样本来帮助诊断链球菌性咽喉炎。这可能比其他类型的诊断测试更准确。鹅口疮也可以通过口腔拭子诊断。也可以使用口腔拭子进行药物测试。一些药店也可能提供用于检测药物的口腔拭子测试。

口腔黏膜样本对于小孩子采样会居多，这个样本不伤害孩子，方式简单，好操作口腔拭子采集注意事项：吸食母乳的孩子尽量不要采集口腔粘膜样本;不同人的样本分开采集，分开包装，备注清楚名字，不要混淆了避免用手触及口腔棉签。所有测试人员请先用清水漱口，孩子在喝奶的情况下，请隔1个小时后再进行口腔取样;收集样本的基本卫生条件：清洁的双手，新的口腔棉签(药店出售的单头棉签)、干净的信封。用棉签伸到口腔内，棉签头轻刮取口腔内两侧(内颊、腮帮子处)及舌下处，可轻轻的旋转或刮动10次左右后再取出，重复取3-5根即可。注意;在采集过程中请不要用手触及口腔棉签的棉球部分，请稍用力旋转并刷动以保证获得足够的DNA。

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